9月21日0—24时，31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例41例。其中境外输入病例25例(云南14例，上海6例，福建2例，广东2例，四川1例)，含2例由无症状感染者转为确诊病例(福建1例，四川1例);本土病例16例(福建13例，其中厦门市11例、莆田市2例;黑龙江3例，均在哈尔滨市)。无新增死亡病例。新增疑似病例2例，均为境外输入病例(均在上海)。
当日新增治愈出院病例37例，解除医学观察的密切接触者797人，重症病例较前一日增加2例。
境外输入现有确诊病例532例(其中重症病例5例)，现有疑似病例4例。累计确诊病例8868例，累计治愈出院病例8336例，无死亡病例。
截至9月21日24时，据31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告，现有确诊病例984例(其中重症病例14例)，累计治愈出院病例90231例，累计死亡病例4636例，累计报告确诊病例95851例，现有疑似病例4例。累计追踪到密切接触者1182333人，尚在医学观察的密切接触者16770人。
31个省(自治区、直辖市)和新疆生产建设兵团报告新增无症状感染者9例(均为境外输入);当日转为确诊病例2例(均为境外输入);当日解除医学观察14例(均为境外输入);尚在医学观察的无症状感染者342例(境外输入333例)。
累计收到港澳台地区通报确诊病例28381例。其中，香港特别行政区12166例(出院11878例，死亡213例)，澳门特别行政区63例(出院63例)，台湾地区16152例(出院13742例，死亡840例)。
